分子篩大量進水后需停止好幾個周期的再生才干除去產品中的水分，因為本產品具備吸附功用，如果不及時處理很容易影響使用。通常的做法是，關閉進塔總閥，只是在兩個產品之間切換吸附，應用沒進水的產品后的空氣再生進水的。
但是，當進水的產品轉為運轉的，其后面的水分進入沒進水的。這樣兩臺產品都有水，然后相互再生，隨著吸附再生，含水量都減小，后同時都具備吸附條件。產品大量進水后，應用上述辦法再生，但是導致兩個產品都有大量水，兩個都再生，后都失去了吸附作用。
大量進水后，水分和分子篩作用，水由游離態的水變成了產品的結晶水，即便再生溫度為200度也不能去除結晶水，需拿到廠家400度回爐才干恢復產品的吸附功用。
總之，分子篩進水后會嚴重影響產品的使用效果，所以要想保證產品使用，除了要及時進行進水處理，還要做好相應的保存措施。
